Šis baltymas atlieka daug įvairių funkcijų imuninėje sistemoje, audinių regeneracijoje ir medžiagų apykaitoje. Infekcijos metu šis baltymas atsakingas už greitą imuniteto atsaką į infekcijos priežastį, o veikiant įgytam imunitetui, jis reikalingas, kad prasidėtų antikūnų gamyba. Todėl natūralu, kad padidėjusi interleukino-6 koncentracija aptinkama infekcinių ligų metu, bei gali nurodyti infekcijos sunkumą. Ilgalaikė per didelė interleukino-6 koncentracija susijusi su išsėtinės mielomos, reumatoidinio artrito, psoriazės, Castleman ligos bei pomenopauzinės osteoporozės išsivystymu.